曾用刊名：《上海铁道大学学报》医学辑并入
《同济大学学报（医学版）》是由教育部主管、同济大学主办的综合性医学类学术期刊，创刊于1980年，双月刊。以基础医学与临床医学研究为主，国内外公开发行，本刊面向全国和海外作者征稿，主要开辟栏目有基础研究、临床研究、调查研究及综述等，非学术性论文不受理。
《同济大学学报（医学版）》属中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊），被美国《化学文摘》（CA）、中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）、中国学术期刊网络出版总库（中国知网）、中国核心期刊（遴选）数据库（万方）、中国生物医学文献光盘数据库（CBMdisc）、中文生物医学期刊文献收据库（CMCC）、中文科技期刊数据库（维普）、中国学术期刊评价研究报告（RCCSE）核心期刊、超星学术期刊“域出版”平台收录。自1980年以来，本刊多次获各级优秀科技期刊评比奖项。2011年获得上海市期刊优秀编校质量奖；2018年获得“第三届上海市高校优秀科技期刊”“中国高校优秀科技期刊”；2019年获得“中国高校科技期刊优秀团队”；2020年获得“中国高校优秀科技期刊”；2021年获得“第四届上海市高校优秀科技期刊奖”。目前，本刊是上海市期刊协会、上海市科技期刊协会、上海市高校科技期刊研究会理事单位。